1. От ацетил-КоА основной путь биосинтеза ведёт к активированным жирным кислотам (подробнее см. Питание. Органические вещества), из которых затем синтезируются жиры, фосфолипиды, гликолипиды и другие производные жирных кислот. В количественном отношении этот путь является главным в животных и в большинстве растительных тканей.
2. Второй путь биосинтеза ведёт от ацетил-КоА к 3-изопентенилдифосфату («активному изопрену»), главному структурному элементу изопреноидов. Биосинтез этого соединения обсуждается в связи с биогенезом холестерина (см. Биосинтез холестерина).