На схеме представлены основные окислительно-восстановительные системы митохондриального электронного транспорта и их приблизительные окислительно-восстановительные потенциалы. Эти потенциалы важны для переноса электронов, так как для обеспечения спонтанного переноса члены окислительно-восстановительного ряда должны располагаться в порядке возрастания потенциалов (см. Методы выделения и анализа белков).
В комплексе I электроны переносятся от НАДН на ФМН (FMN, см. Устройство и функционирование эндоплазматического ретикулума и аппарата Гольджи), а затем на железосодержащие белки (Fe/S-центры). Эти окислительно-восстановительные системы стабильны только в составе молекул белков. Они могут содержать от 2 до 6 ионов железа, образующих комплексы различного состава с неорганическим сульфидом и SH-группами остатков цистеина. На схеме показана структура так называемого Fe4S4-центра.
В переносе электронов принимают участие различные типы гемов. Гемы типа b соответствуют гемоглобинам (см. Транспорт газов). Гем с ковалентно связан с белком, в то время кактетрапиррольное кольцо гема a изопренилировано и несёт формильную группу. В комплексе IV непосредственно с кислородом взаимодействуют ион меди (CuB) и гем a3. Свойства кофермента Q и цитохрома с рассмотрены на Дыхательная цепь.