Преобладающая в клетке конформация ДНК (так называемая В-ДНК) представлена схематически на схеме 1, а также на с. Биосинтез нуклеотидов, в виде вандерваальсовой модели. На схеме 1 дезоксирибозофосфатный остов изображён в виде ленты. Основания (здесь указаны в виде полос) расположены внутри двойной спирали. Следовательно, эта область ДНК неполярна.
Напротив, внешняя сторона молекулы полярна и заряжена отрицательно за счёт углеводных остатков и фосфатных групп остова. Цепи ДНК на протяжении всего тяжа образуют два желоба, которые носят названия «малая бороздка» и «большая бороздка».
Так как обе цепи связаны только нековалентными взаимодействиями, двойная спираль при нагревании или инкубации в щелочном растворе легко распадается на отдельные цепи (денатурирует). При медленном охлаждении ранее неупорядоченные отдельные цепи благодаря спариванию оснований вновь образуют двойную спираль (молекула ренатурирует). Процессы де- и ренатурации играют важную роль в генной инженерии (см. Клонирование ДНК, Полимеразная цепная реакция).
В функциональном отношении две цепи ДНК не эквивалентны. Кодирующей цепью (матричной, смысловой) является та из них, которая считывается в процессе транскрипции (см. Транскрипция). Именно эта цепь служит матрицей для РНК. Некодирующая цепь (антисмысловая) по последовательности подобна РНК (при условии замены Т на U). Общепринято давать структуру гена в виде последовательности некодирующей цепи ДНК в направлении 5′→3′. Если прочитать кодоны в этом направлении, то с помощью генетического кода (см. Генетический код, активация аминокислот) можно воспроизвести аминокислотную последовательность белка в принятом порядке, от N- к C-концу.
Principles of Biomedical Informatics Biomedical informatics (BMI) is an extraordinarily broad discipline. In scale, it spans across genes, cells, tissues, organ systems, individual ...
Биофизика Настоящая книга представляет собой обстоятельный курс современной биофизики, ...